巴拉圭河发源于巴西马托格罗索省迪亚曼蒂努南。它向西南流过巴西的卡塞雷斯市，然后转向南，流过潘塔纳尔湿地和科伦巴市后成为巴西与玻利维亚的一小段边界河。
然后它又成为巴拉圭和巴西的边界河，这样它向南继续流约220千米。
此后巴拉圭河缓慢地向南东南方向转，由北向南贯穿巴拉圭中部，在流过巴拉圭中部后又重新转向西南方向。巴拉圭被巴拉圭河分为东西两个非常不同的部分：西部的大查科地区人烟稀少，半干旱，东部则是森林地区，巴拉圭98%的居民住在这里。因此巴拉圭河是巴拉圭最重要的一个地理现象。
巴拉圭河流过巴拉圭中部约400千米后皮科马约河注入巴拉圭河，然后它流经巴拉圭的首都亚松森，成为巴拉圭与阿根廷的边界河，这样它继续向南西南方向流275千米后注入巴拉那河。
Der 2549 km lange in Südamerika fließende Río Paraguay, port. Rio Paraguai, ist der bedeutendste Nebenfluss des Río Paraná. In seinem Oberlauf heißt er auf Portugiesisch Rio Paraguai, in seinem Unterlauf auf Spanisch Río Paraguay. Die Bezeichnung auf Guaraní lautet Ysyry Paraguái. Der Name bedeutet „Wasser, das zum Wasser geht“, abgeleitet von der Sprache der Ureinwohner, Guaraní: pará („Ozean“), gua („zu/von“) und y („Wasser“).Der Río Paraguay entspringt in Brasilien im gebirgigen Hochland von Mato Grosso ungefähr 115 km nördlich von Cuiabá. Von dort aus fließt der Río Paraguay in südlicher Richtung. Er verlässt das Hochland und durchquert die Niederung des Pantanal. Dort fließt er zumeist parallel zur bolivianischen Grenze. Im Süden des Pantanals bildet er die Grenze zwischen Brasilien und Paraguay. Anschließend durchquert er Paraguay in Nord-Süd-Richtung und durchquert dabei die paraguayische Hauptstadt Asunción. Dort vereinigt er sich auch mit seinem größten Nebenfluss, dem Río Pilcomayo. Unmittelbar danach bildet er die Grenze zwischen Paraguay und Argentinien. Etwas nördlich von Corrientes mündet er in den Paraná.
